表观组学小组开始招人啦
等你加入
虽然说条条大路通罗马,但总得走一条路吧~
生物信息学的入门也是如此,据调查,19%的朋友是通过分析表观组数据入门的!
而且mRNA-seq和ChIP-seq结合起来分析转录调控已经成为了主流。
现在机会来了~
生信技能树组建了从表观组开始入门生物信息学的微信交流群!
这里有小白有大神,你可以和大家尽情交流,获得JIMMY等大神的帮助,也许你是大神,也许你是刚入门的小白,现在的你在什么位置都不重要,重要的是你往什么方向走。只要你想学习,有兴趣学习,都可以加入!
WGS,WES,RNA-seq组与ChIP-seq之间的异同
读 Jimmy 前辈的《Chip-seq 实战分析》后感:新司机驾考不完全指南
上面的笔记就是加入微信群的小伙伴第一步需要达到的目标,约耗时两个月,我会像转录组一样给出大纲,也会有很多小伙伴分析自己的笔记,大家一起学习。
微信群交流什么?
1. 记录并理解一些常见的概念&技术原理
感觉做表观这些应该是必知的,也可以归纳到技能部分边练边学
DNA methylation 常见的reader, writer, eraser列表
Histone modification 同DNA methylation
ChIP-seq: 目前lab最最常用的技术了,大致就是通过免疫共沉淀的方法找到和某感兴趣蛋白或者修饰(通过识别该修饰的蛋白IP实现的)在基因组上的富集情况,即亲和位点
WGBS
2. Specific epigenetic processes
由于实验室主要做干细胞相关的如DNA methylation reprogramming, imprinting, 就稍微了解一点,但是其他的似乎也很有趣
paramutation,
bookmarking,
imprinting,
gene silencing,
X chromosome inactivation,
position effect,
DNA methylation reprogramming,
transvection,
maternal effects,
the progress of carcinogenesis,
many effects of teratogens,
regulation of histone modifications and heterochromatin,
and technical limitations affecting parthenogenesis and cloning
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